ポーション類は使用していますか？
他のボスにも言える事ですが、バフポーションを使うと戦いやすくなります。
オススメは、まもりのポーション、リジェネポーションあたりです。
また、おなかいっぱいのバフ効果を持つ、やけたマシュマロも併用するといいでしょう。
材料となるマシュマロは、せつげん環境でしょうにんが売ってくれます。
回復アイテムは、ライフポーションでは心もとないです。
多少手間が掛かっても、おおきなライフポーションを作るといいでしょう。
どうしても近接武器を使いたいのであれば、こまめに動き回りながら攻撃力の高い頭部だけでも避けてください。
プローブを倒すと高確率でハートを落とすので、忘れずに回収しましょう。
余談ですが、デストロイヤーはホーリー防具を一式揃えた頃には雑魚と化します。
極端な話、ホーリー防具一式でエクスカリバーを振り回すだけで勝てたりします。