ハードモードという事で、大事な事を書き忘れていました。
もし、まだダンジョン内にメカニックがいる場合、
プランテラ撃破後のダンジョンでは、メカニックがモンスターに秒で殺される確率が高いです。
ダンジョン内にはダンジョンスライム以外、通常のダメージ音がするモンスターは出現しないため、
「バシバシ、グシャッ」という音がしたらほぼ間違いなくメカニックがいます。(そして死んでます)
ちなみに各手順を要約すると、
① メカニックがワールドにいるか
② NPCが出現するかどうか
③ 住める家があるかどうか
④ バグによって救出されていない事になってないか
です。
別のワールドのエラーが影響を及ぼす可能性も考えられます。
関連は不明ですが、3DS版のワールドのデータが消えるといった報告もあります。
→Thread:ノート:質問掲示板/データ消失の対策