イーターのホネはドロップ率が5%という低さなので、単純に運の問題…とも言い切れないところがあります。
※私は3DSとPS3ユーザーなので、以下の記述が的外れでしたら申し訳ありません
もしこの条件に当てはまる時があった場合は、残念ながらバグです。
原因や条件が解明されていないので対処法が分からないのですが、3DS版ではかなり致命的なバグとして知られており、イーターのホネやトロフィーが入手困難となっています。
この条件に当てはまらず、倒した際にちいさなライフポーション等がドロップしているようなら、あとは確率の問題です。新しいワールドを作成してチャレンジするなり、今のワールドで頑張るなりしてみてください。
入手できるようお祈りしています。頑張ってくださいね。