アップデート済みなんですが変わらずですね。
でも原因かもしれないと思うものは見つけまして、
隕石が落ちると落下現場にメテオライトが正常に表示されず(見た目土ブロックのままで掘るとメテオライトが出る等)そのまま放置すると次回ログイン時にバグっていたり、
中身が入ったままの宝箱部分を削るとバググラフィックだけ消えて、そこに宝箱が残り続け(ホストだけに見える)そのままにしておくと永続的に発生しまったりなど、
おっしゃる通りチャンクバグのようなものなのかもしれないです。
いろいろ試した結果、解決策として隕石の落下現場は余すこと無くくり抜く、上記画像の場合バグってる部分をすべて壊し再度ログインし直す事で再発は防げています。
ただ次に何かしらの原因で発生するものに関してはその都度対処しなくてはならないので面倒ですが…。